Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HECTD4Q9Y4D8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms