Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms