Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
KRT84Q9NSB2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms