Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGAM5Q96HS1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PGAM5Q96HS1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PGAM5Q96HS1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PGAM5Q96HS1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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