Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms