Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WHAMMP3Q1A5X7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WHAMMP3Q1A5X7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms