Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC3Q15034 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HERC3Q15034 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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