Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PMS2P11Q13670 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms