Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TRAF2Q12933 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAF2Q12933 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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