Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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