Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms