Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA4BQ9NPR2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms