Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms