Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms