Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPPQ6IPU0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPPQ6IPU0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms