Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AP5B1Q2VPB7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms