Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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