Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
WDR4P57081 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms