Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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PGGT1BP53609 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PGGT1BP53609 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PGGT1BP53609 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PGGT1BP53609 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PGGT1BP53609 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PGGT1BP53609 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PGGT1BP53609 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PGGT1BP53609 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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