Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THOP1P52888 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THOP1P52888 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms