Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP2O75323 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms