Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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