Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLHC1Q8NHS4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLHC1Q8NHS4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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