Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NKPD1Q17RQ9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms