Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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