Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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