Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms