Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GATA1P15976 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms