Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEMP2A6NFY4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms