Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RABGEF1Q9UJ41 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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