Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CTF1Q16619 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTF1Q16619 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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