Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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SS18Q15532 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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