Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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