Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms