Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVPABLB-1P60509 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms