Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF10O60809 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PRAMEF10O60809 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PRAMEF10O60809 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PRAMEF10O60809 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PRAMEF10O60809 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PRAMEF10O60809 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF10O60809 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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