Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA6L4A6NEF3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA6L4A6NEF3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms