Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms