Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHACTR1Q9C0D0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms