Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT20Q8IY31 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms