Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APTXQ7Z2E3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms