Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF06

TRMT10B, tRNA methyltransferase 10 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10BQ6PF06 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRMT10BQ6PF06 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms