Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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C10orf55Q5SWW7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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C10orf55Q5SWW7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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C10orf55Q5SWW7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
C10orf55Q5SWW7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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