Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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