Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CA9Q16790 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CA9Q16790 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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