Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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IRF8Q02556 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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