Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTRA4P83105 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms