Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV4P43268 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV4P43268 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV4P43268 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV4P43268 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV4P43268 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms