Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CXCL3P19876 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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