Protein–RNA interactions for Protein: O95049

TJP3, Tight junction protein ZO-3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP3O95049 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TJP3O95049 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TJP3O95049 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms